开发商逾期办证违约金的计算方法主要依据双方签订的房屋买卖合同中的约定，以及相关法律法规的规定。以下是一个详细的解析：

　　一、合同有明确约定的情况

　　按照合同约定计算：

　　如果购房合同中明确约定了逾期办证违约金的计算方式(例如按日计算、按月计算或一次性支付等)，则应按照合同中的约定进行计算。

　　计算基础：

　　违约金的计算通常基于已支付的购房款总额。

　　起算日期和截止日期：

　　起算日期：根据合同约定的办理房屋所有权登记的期限届满之次日起算。

　　截止日期：通常至开发商实际办理完毕房屋所有权登记之日止。

　　二、合同没有约定或约定不明确的情况

　　参照法律规定：

　　如果合同中没有约定或约定不明确，可以参照相关法律法规的规定，如《最高人民法院关于审理商品房买卖合同纠纷案件适用法律若干问题的解释》等，来确定违约金的计算方法。

　　金融机构计收逾期贷款利息标准：

　　在没有明确约定的情况下，一些法院可能会参照中国人民银行规定的金融机构计收逾期贷款利息的标准来计算违约金。

　　考虑实际损失：

　　法院或仲裁机构在确定违约金数额时，也会考虑买受人的实际损失，并根据公平原则和诚实信用原则进行衡量。

　　三、注意事项

　　合同审查：购房者在签订购房合同时，应仔细审查合同条款，特别是关于办理房产证期限和违约责任的约定。

　　咨询专业人士：在遇到逾期办证问题时，购房者应咨询专业律师或房地产部门以获取准确的法律建议。

　　及时维权：购房者应在诉讼时效期间内及时主张权利，以避免超过诉讼时效而丧失胜诉权。

　　综上所述，开发商逾期办证违约金的计算方法需结合房屋买卖合同中的具体约定以及相关法律法规的规定来确定。购房者在遇到此类问题时，应及时咨询专业法律人士以维护自身权益。