逾期办证违约金的诉讼时效起算时间主要基于《中华人民共和国民法典》的相关规定，并结合购房合同的具体条款来确定。以下是对逾期办证违约金诉讼时效起算时间的详细分析：

　　一、法律依据

　　根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。

　　二、起算时间

　　合同约定明确时：

　　如果购房合同中对逾期办证违约金有明确的约定，并且约定了具体的支付期限，那么诉讼时效的起算时间可以从合同约定的支付期限届满之日起算。例如，合同可能约定开发商应在交房后一定期限内为购房者办理房产证，并约定逾期办证违约金的支付期限为办证期限届满后的某个具体日期。在这种情况下，如果开发商未能在约定期限内支付违约金，购房者应在支付期限届满之日起三年内提起诉讼或采取其他有效措施。

　　合同约定不明确或无法履行时：

　　如果购房合同中没有明确约定逾期办证违约金的具体数额或计算方法，但法律法规对逾期办证有明确的期限规定，或者合同虽约定但开发商无法履行，那么诉讼时效的起算时间可以从购房者知道或应当知道权利受到损害之日起计算。这通常意味着，购房者应在发现开发商逾期办证后的一定合理时间内(如三个月内)，意识到自己的权利受损，并据此计算诉讼时效的起算时间。

　　法定期限届满时：

　　在某些情况下，法律法规可能直接规定了开发商办理房产证的法定期限。如果开发商未能在该法定期限内为购房者办理房产证，购房者可以在法定期限届满之日起三年内提起诉讼或采取其他有效措施。

　　三、注意事项

　　诉讼时效的中断与重新起算：在诉讼时效期间内，如果发生特定事件(如购房者向开发商主张权利、提起诉讼或仲裁、开发商同意履行义务等)，可能导致诉讼时效的中断，并重新起算。

　　及时主张权利：购房者应在知道或应当知道权利受到损害之日起三年内及时主张权利，避免超过诉讼时效而丧失法律保护。

　　保留相关证据：购房者应妥善保管购房合同、付款凭证、开发商的承诺书等与逾期办证相关的证据，以便在诉讼或仲裁中证明自己的主张。

　　四、案例分析

　　假设某购房合同约定开发商应在交房后90日内为购房者办理房产证，并约定逾期办证违约金的支付期限为办证期限届满后的30日内。如果开发商在交房后120日仍未办理房产证，也未支付违约金，那么购房者可以在违约金支付期限届满之日起三年内(即交房后150日起的三年内)提起诉讼或采取其他有效措施。如果购房合同中没有明确约定支付期限，但法律法规规定了办证的法定期限，那么诉讼时效的起算时间将从购房者知道或应当知道开发商逾期办证之日起计算。

　　综上所述，逾期办证违约金的诉讼时效起算时间取决于购房合同的具体约定和法律法规的规定。购房者在面对开发商逾期办证时，应充分了解自己的权利和法律规定，及时主张权利并保留相关证据。